膜清洗时的物理方面如温度、机械作用力、时间是在膜清洗过程中应关注的要点，甚至在膜清洗中最重要的"溶剂"--水也应该具有最好的水质，否则清洗过程的本身就可能成为污染的原因。
温度
众所周知，温度的增加可以加快反应过程，对于清洗过程也是如此。作为一个经验值可以说温度每增加10℃，清洗效果就加倍。虽然取决于不同的污染物质，但是最小温度还是需要的，我们除盐水厂所使用的聚合有机膜就不能超过50℃，若超出这个温度就会对膜产生严重的破坏，可见温度必须适当，适当的温度可以起到良好的效果。
机械力
流量与清洗效果之间有着较大的关系，较高的流动速率产生较高的湍流程度以及较好的乳化和分散特性。而流动速率的增加受到泵的能力、机械稳定性和经济上限制。对于反渗透膜而言，绝大部分污染物和沉积层是直接位于膜的表面，因此在清洗的时候，应当尽可能地降低其过滤能力，否则就有可能在清洗过程中产生二次形成膜。最好是先用低压清洗以松动膜面滤饼，再将初次清洗液排出，最后改为高压清洗膜孔。
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